Groot jugó un papel en Annihilation: Conquest, momento en el que podría ser el último de su especie, en que tiempo se demostró que Groot puede ser el último miembro restante del Flora Colossi, y fue arrestado por el Kree por una razón desconocida. Groot ganó la libertad uniéndose a Star-Lord, donde Groot y Rocket Raccoon formaron un enlace, Rocket siendo uno de los pocos seres con la capacidad de entender el lenguaje de Groot.9​El equipo de Star-Lord luchó su camino a través de la Falange, pero después de la muerte de Deathcry, el equipo decidió escapar a través de una tubería de drenaje que Groot no podía encajar.

Groot aparentemente murió, ayudando el equipo algún tiempo para escapar de la batalla.10​Groot sobrevivió como una ramita y siguió para acompañar al equipo en su misión continuada contra la Falange, pero era uno de los miembros del equipo capturados por la Falange.11​Groot y los otros fueron liberados por Mantis, y escaparon de nuevo a las líneas de la resistencia Kree. Con el tiempo, el cuerpo de Groot se regeneró de la ramita, creciendo de nuevo a su tamaño completo. Groot y los otros pretendían continuar como parte del equipo de Star-Lord.12​

Groot y el equipo regresaron a Hala para preparar otro ataque contra la Falange, pero su agente Blastaar fue capturado por la Falange y llevado a su Aguja de Babel mientras trataba de llevar las esporas de polen de Groot. Groot y Rocket Racoon continuaron su misión al entrar furtivamente en el sub-sótano de la Aguja de Babel.13​Cuando Star-Lord fue capturado por Ultron, el plan original de la colocación de explosivos en el Spire fracasaron, por lo que Rocket y Groot fueron necesarios para llegar a un nuevo plan.14​Groot decidió brotar dentro de la Aguja, creciendo a tamaño colosal y llenando una gran parte del edificio.

Mantis fue capaz de remixar la savia de Groot de una manera que la hace extremadamente inflamable, y Groot murió de nuevo por el equipo, esta vez encendiendo intencionalmente para que el fuego resultante destruyera la Aguja de Babel. Un corte de Groot fue mantenido por Rocket Raccoon, sin embargo, y Groot fue de nuevo capaz de volver a crecer. Groot entonces se unió a los nuevos Guardianes de la Galaxia (o, como Groot lo tendría, "Groot y Ramos"), y comenzó a crecer de nuevo bajo el cuidado de Mantis.15​16​

Cuando los Guardianes se reformaron, Groot se unió a Star-Lord, Rocket Raccoon, Drax el Destructor y Gamora, a quienes Groot contó como amigos.17​

Durante la historia de las Guerras Secretas de 2015, Groot está con los Guardianes de la Galaxia cuando participan en la incursión entre la Tierra-616 y la Tierra-1610. Groot y Rocket Raccoon son asesinados por los Niños del Mañana. Sin embargo, cuando Peter Quill - uno de los pocos sobrevivientes de las incursiones de la Tierra-616 - se encuentra enfrentado por Cisne Negro en el castillo del emperador Doom, que revela que ha estado llevando a una pequeña ramita de Groot en el bolsillo desde la incursión, golpeándola en las raíces del árbol del mundo y haciendo a Groot de transformarse el árbol gigante en su cuerpo, diezmar el castillo de Doom mientras que los héroes supervivientes montan su ataque final.18​

Durante la historia de Civil War II, Groot y los Guardianes de la Galaxia son convocados por el Capitán Marvel para ayudarla en su lucha contra el lado del Hombre de Hierro cuando se trata del destino del Inhumano Ulises Caín. La batalla resultante dañó la nave de los Guardianes de la Galaxia que los dejó varados en la Tierra.19​

Durante la historia de "Monsters Unleashed", los Guardianes de la Galaxia defienden a Groot de un Leviathan con cabeza de serpiente.20​

Durante la historia del "Imperio Secreto", Groot y el resto de los Guardianes de la Galaxia ayudan al Capitán Marvel, el Programa espacial de vuelo Alpha, a los miembros de los Ultimates, Hyperion y Quasar a interceptar una flota de Chitauri que se acerca a la Tierra hasta un Hydra alineado - Steve Rogers activó el Escudo de Defensa Planetario atrapando a aquellos que luchan contra los Chitauri fuera de la atmósfera de la Tierra.21​Star-Lord, Rocket Raccoon y Groot intentan reclutar representantes de los imperios Skrulls, Kree, Brood, Shi'ar y Spartax que están en el Consejo Galáctico para ayudar contra las hordas de Chitauri y destruir el Escudo de Defensa Planetario y deshacerse de él. de Hydra. Al darse cuenta de que ahora se enfrentan a una galaxia sin interferencia humana, el Consejo Galáctico se niega a ayudar e intentan matar a los tres Guardianes mientras huyen.22​Después de que el Escudo de Defensa Planetario se cierre, Groot y los Guardianes de la Galaxia se unen a la batalla final contra Hydra.23​

Rocket Raccoon y Groot están en camino hacia el Anillo Stohlad cuando son emboscados por Gardener donde destrozó a Groot porque los Guardianes de la Galaxia lo "corrompieron" y lo devastaron de su verdadero propósito. Rocket Raccoon escapó con una astilla donde Groot cultivó un nuevo cuerpo.24​

Durante la historia de "Infinity Countdown", Groot estaba con los Guardianes de la Galaxia cuando se da cuenta de que el planeta Telferina está bajo el ataque de los Colosos Flora que Gardener creció a partir de las astillas de Groot. Groot se acercó a Gardener y usó sus poderes de curación para purgar el veneno que Loki le había puesto en su cuerpo. Gardener le pagó a Groot usando sus habilidades para restaurar a Groot a su tamaño anterior. Además, Groot ahora puede hablar en oraciones completas y se refiere a sí mismo en tercera persona