Gamora es la última de su especie, los Zen Whoberi, quienes fueron exterminados por los Badoon (en su línea temporal original, su especie fue exterminada por la Iglesia Universal de la Verdad). Thanos encontró a la niña y decidió utilizarla como un arma. Gamora fue criada y entrenada por Thanos para asesinar a Magus, un malvada versión alterna de Adam Warlock. Thanos mostró su poca humanidad en su infancia, pero Gamora fue muy leal al hombre que le prometió la oportunidad de vengar la muerte de su familia. Gamora pronto dominó las artes marciales, ganándose el apodo de "la mujer más letal en toda la galaxia". Cuando ella era una adolescente, Thanos la llevó en un viaje. Gamora desobedeció las órdenes de Thanos, y debido a esto entró en conflicto con unos maleantes. Ella fue superada enormemente en número, y a pesar de sus habilidades fue derrotada y luego violada por uno de los agresores. Thanos la encontró medio muerta, y a su vez asesinó a todos los agresores y le devolvió la salud, mejorando cibernéticamente sus habilidades a niveles sobrehumanos.

De adulta, Gamora fue enviada como una asesina contra la Iglesia Universal de la Verdad, siendo rápidamente temida por sus agentes, los Caballeros Negros. Ella se vengó por el genocidio de su raza, asesinando a todos los miembros de la Iglesia involucrados antes de que realmente ocurriera el acontecimiento. Gamora conoció y se unió a Adam Warlock, quien quería detener a su vieja versión.1​2​ Ella incluso consiguió estar cerca de Magus, pero finalmente falló en asesinarlo. Junto con Warlock, Pip el Troll y Thanos, Gamora luchó para escapar de los Caballeros Negros de la Iglesia Universal de la Verdad y el Escuadrón de la Muerte de Magus.3​4​5​Más tarde fue asignada por Thanos para proteger a Adam Warlock, pero ella comenzó a sospechar de los planes de Thanos, para después ser atacada por Drax el Destructor.6​

Finalmente, Magus fue derrotado, pero Thanos se reveló a sí mismo como una amenaza mucho mayor. Gamora ayudó al Capitán Mar-Vell, Drax, y a los Vengadores contra Thanos. Ella y Pip trataron de impedir que Thanos destruyera toda la vida en el universo. Gamora intentó matar a Thanos, pero él la hirió mortalmente, y destruyó la mente de Pip.7​Adam Warlock los encontró, y Gamora le advirtió a Adam de los planes de Thanos. A continuación, Warlock absorbió su alma dentro de la Gema del Alma. Cuando Adam Warlock también murió, su espíritu se reunió con el de sus amigos en el "Mundo de Almas", dentro de la Gema.